В 1946-1950 гг. немало усилий было затрачено на восстановление и дальнейшее развитие народного образования. За этот период было введено в действие 18,5 тыс. школ для 2,5 млн школьников. В городах и рабочих поселках стали создаваться школы рабочей молодежи. Начался переход ко всеобщему семилетнему обучению. Острый дефицит специалистов с высшим и средним образованием потребовал от государства повышения расходов на систему образования.
В 1946 г. было выделено на развитие высшей школы 3,8 млрд рублей, в 1950 г. — 5,7 млрд рублей. В стране начали открываться новые университеты и вузы, повсеместно внедрялись вечерняя и заочная формы обучения. За первые пять послевоенных лет было подготовлено 652 тыс. молодых специалистов. Вместо Всесоюзного комитета по делам высшей школы в 1946 г. было создано Министерство высшего образования СССР, в 1950 г. был организован Отдел науки и высших учебных заведений ЦК ВКП(б).
По сравнению с 1945 г. в 2,5 раза была увеличена сумма расходов на науку. Это позволило уже в 1946 г. восстановить Академии наук Белоруссии, Литвы и Украины, создать 16 новых филиалов АН СССР, в том числе в Сибири, Дагестане и Якутии. Значительное внимание уделялось развитию перспективных направлений, были открыты новые НИИ: Институт точной механики и вычислительной техники, Институт физической химии, Институт атомной энергии, Институт ядерных проблем и др. Основной упор в деятельности научных коллективов делался на развитие оборонного комплекса, наращивание военного потенциала страны.
В августе 1945 г. был образован специальный комитет по созданию атомной бомбы. Организационнотехнические вопросы были поручены известному руководителю военной экономики Б.Л. Ванникову, а научные исследования — академикам А.И. Алиханову, А.Ф. Иоффе, П.Л. Капице, И.В. Курчатову, Ю.Б. Харитону. Комитет, наделенный особыми полномочиями, курировал Л.П. Берия. В результате трех лет интенсивной работы была создана первая советская атомная бомба, испытание которой прошло 29 августа 1949 г. на ядерном полигоне под Семипалатинском.
На развитие оборонного комплекса государство выделяло любые средства. В СССР активно разрабатывалось химическое и бактериологическое оружие, развивалось самолетостроение и подводный флот.
Под пристальным партийногосударственным контролем находились не только те отрасли науки, которые работали «на оборонку», но и любые другие, где предполагалось даже малейшее отклонение от генеральной линии.
На сессии ВАСХНИЛ (август 1948 г.) были объявлены ошибочными и даже вредными такие науки, как генетика и молекулярная биология. Тогда победили сторонники академика Т.Д. Лысенко с их псевдоучениями о чудокультурах и агроприемах, способных одним махом изменить положение дел в сельском хозяйстве. Перспективные исследования были свернуты, начались преследования ученых. Академика Л.А. Орбели, ближайшего сподвижника И.П. Павлова, обвинили в том, что он протаскивает в советскую науку вредные бациллы «менделизмаморганизма». В 19481950 гг. отступниками и антипатриотами были объявлены почти все крупнейшие ученые — биологи и физиологи: академики Н. П. Дубинин, А. Р. Жебрак, П. М. Жуковский, И. И. Шмальгаузен, А. Д. Сперанский. Враждебной павловскому учению об условных рефлексах была признана школа грузинского физиолога академика И. С. Бериташвили. Буржуазными лженауками стали кибернетика и социология.
В 1945 г. вернулся на родину ученыйгенетик Н. В. Тимофеев-Ресовский. Он 25 лет прожил в Германии с советским паспортом, оставаясь верным России. Все эти годы добровольного изгнания Н. В. Тимофеев-Ресовский отказывался сменить гражданство. Он посылал свои труды в библиотеку Московского университета, не подозревая, что они будут недоступны для советских ученых.